抖音小游戏被永久下架后，同一个主体能否再申请版号并重新上架，取决于下架原因。因严重违规（如套版号、涉黄涉赌、恶意对抗监管）被永久下架，平台会将违规主体拉黑，90天内禁止提审新游戏。行政处罚记录将被计入企业信用档案，出版单位在签约版号前会对历史背景进行尽职调查。若违规记录情节严重，公司实际控制人可能被列入行业失信名单，丧失继续申报版号的资格。

因版号缺失或内购违规被下架，主体合规后仍可重新申请版号。开发者需要先将违规游戏下架，完成合规整改，提供详细的整改报告，向平台申诉恢复账号的提审权限，再重新走软著、版号、备案的上线流程。如果版号已获批但因内购违规导致下架，版号本身不会作废，但游戏名称和主体信息需与平台资质对齐。成都盈众九州网络科技有限公司可帮助企业在下架后进行合规整改，恢复账号提审权限，重新走通合规上线路径。