当一款游戏存在研发方、运营方、渠道方多家主体联合运营时，版号申报资料不能只提交单一主体的资质，必须补充全套合作协议资料，明确谁是申报主体、各方权责，避免出现版权、运营责任模糊，审核不予受理。
首先要确定唯一的版号申报主体，也就是和出版单位对接、出现在版号批复文件上的主体。其他合作方，需要通过合作协议授权申报主体办理版号申报、出版、上线运营相关事宜。核心资料就是联合运营/联合开发协议，协议必须写明各方主体全称、统一社会信用代码，协议有效期覆盖申报、上线运营周期。
协议内必须写清楚知识产权归属：游戏源码、美术、软著是归研发方所有，还是多方共有；申报主体获得的授权范围，是否包含出版申报、商业化运营、版本报备。如果知识产权不属于申报主体，协议里面必须写明独占授权，允许申报主体单独提交版号相关材料，不需要每次申报都征得其他合作方同意。
其次要划分内容责任、合规责任。明确由哪一方负责游戏内容修改、配合监管问询、版本整改；哪一方负责充值结算、客服、防沉迷运维；同时约定如果出现违规、处罚，各方如何承担责任。审核部门会重点规避多方合作互相推诿责任的情况。
协议附件需要附上所有合作方的营业执照扫描件，协议落款处每一家合作企业都需要加盖公章。如果只是渠道联运，渠道只负责分发、不参与研发和内容修改，一般不需要渠道方加入申报协议，只需要研发运营主体提交资料即可，不要混淆研发联运和渠道分发的区别。
很多联运项目踩坑，协议只写收益分成，没有写出版申报、内容合规相关授权条款，提交资料之后被要求重新补签协议，耽误申报进度。协议不能是简单的框架合同，和版号申报相关的授权条款必须清晰、无歧义。
